秋季处于夏季和冬季之间，所以夏季传染病和冬季传染病都有可能在秋季发生。须重点预防的传染病主要有：霍乱、副霍乱、伤寒、副伤寒、痢疾、病毒性肝炎、轮状病毒腹泻等肠道传染病；白喉、水痘等呼吸道传染病；流行性出血热、流行性乙型脑炎、疟疾等自然疫源性疾病。
肠道传染病
肠道传染病是由细菌、病毒引起的经消化道传播的疾病。具有发病急、传播快的特点。临床上最常见的肠道传染病为甲肝和菌痢。
肠道传染病的预防，重点在于养成良好的饮食卫生习惯，防止病从口入。勤洗手，不喝生水，不吃腐败变质食物，瓜果蔬菜要洗净，肉食品要妥善保存并烧熟煮透。搞好家庭室内外环境卫生，清除卫生死角及积存垃圾，注意灭蝇、灭鼠。发现有消化道不适症状，应及时就医，不要自行胡乱用药。
呼吸道传染病
呼吸道传染病是指细菌、病毒引起的经呼吸道传播的疾病。主要通过空气飞沫传播，亦可通过手、食具等其他途径传播。呼吸道传染病具有传染性强、传播速度快等特点，容易在人群中引起传播和流行，起病急、有发热症状，秋季可见白喉、水痘等呼吸道传染病。
预防呼吸道传染病，要勤开窗户，保持空气新鲜。养成良好的卫生和饮食习惯，多吃蔬菜水果，保证足够的营养，多喝白开水。注意体育锻炼，增强体质。在呼吸道疾病流行期间，尽量不去人员拥挤的公共场所。若有发烧或出现上呼吸道症状时，应及时到医院就诊。
虫媒传染病
虫媒传染病，是由病媒生物传播的自然疫源性疾病，常见有流行性乙型脑炎、疟疾等危害性较强的传染病。
在预防虫媒传染病时要做好灭鼠、灭蚊、防蚊、灭虱、灭蚤等工作,切断疾病的传播途径；采取个人防护措施，户外活动时避免蚊虫叮咬；改善居住环境,做好针对性的自我防护。另外，饲养家畜家禽的农村居民，除对家畜、家禽的棚圈应定期喷洒灭蚊灭蝇药物，还要注意与之保持一定的距离。
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