在大多数情况下，答案是肯定的。也就是说Y染色体就是从男性祖先那里祖祖辈辈传下来的,而且几乎没有什么改变。
理解性染色体的遗传规律我们会从父母那里分别继承了23条染色体，总共46条，且两两配对。但其中有一对在男性体内会有些不对称，因为其中包含了一条来自父亲的Y染色体和一条来自母亲的X染色体。而女性则是一条来自父亲的X染色体和一条来自母亲的X染色体。
母亲总是向子女遗传自己两条X染色体中的任意一条，而父亲则会向儿子遗传自己唯一的那条Y染色体，但向女儿遗传自己的唯一的那一条X染色体。当然这条唯一的染色体也是来自男人的母亲的两条X染色体之一，也就是说来自于男人的外祖父或者外祖母。所以：
男性的Y染色体只可能来自于父亲，如果再往上追溯一代的话，就是来自于祖父。
男性的X染色体只可能来自于母亲，若再往上追溯一代的话则可能来自外祖父或者外祖母。
女性的两条X染色体，一条来自于父亲，一条来自于母亲，如果再往上追溯一代的话则可能来自于祖母、外祖母或外祖父，但绝对不可能来自于祖父。
上图：X染色体的遗传，男性的X染色体只能来自于母系，女性的染色体则来自父母，但再往上追溯一代不会来自于祖父。通俗点说，Y染色体永远并且直接来自于爸爸，而X染色体则终归还是来自于某个妈妈（因为男人的X染色体只能妈给）。在有性生殖的过程中，来自父母的两组染色体将“重组”它们的基因，有点洗牌的意味，这意味着这些染色体彼此交换遗传信息，达到某种随机混合的效果。从短期来看，这种“洗牌”的过程意味着儿子或女儿的性格和生理特征的组合很难严格复刻父母。从长远来看，这形成了某种遗传多样性，并有助于消除可能对后代不利的性状。
上图：Y染色体主要基因的功能是涉及性决定以及精子发育。而X染色体涉及的问题就多了，诸如眼睛白化症基因、杜氏肌营养不良症、雄激素不敏感症、严重的组合免疫缺陷、血友病、色盲症，与这些疾病相关的基因都在X染色体上。这导致只有一条X染色体而没有备份的男性更容易患这些遗传性疾病。
Y染色体上有什么？尽管X和Y染色体有一小段是相同的，但是基因测序已确定，超过95％的Y染色体是雄性所特有的，这部分DNA序列被称为Y或MSY的雄性特异性区域。实际上，该区域与X染色体天差地别，以至于我们必须给人们经常引用这个事实：“人类具有99.9％的遗传同一性”加上“仅适用于同性间比较”的这个前提。如果拿男人与女人的遗传物质进行比较，同一性就达不到99.9%了。所以文艺界说“男人来自火星，女人来自金星”还是有点点似是而非的科学根据的，如果有外星人初来乍到，或许他们会认为男人和女人可能是基因略有差异的两个物种。O(∩_∩)O~
Y染色体的男性特异性区域部分在生殖过程中不会与X染色体发生重组，这意味着当父亲在有性生殖过程中贡献Y染色体时，该染色体上的大多数基因都不会与X发生混合。从基因学上讲，Y染色体可以算是无性传播的。
上图：染色体重组示意。两个配对的同源染色体会发生局部遗传物质的交换（不仅仅是DNA哦，还包括缠绕DNA的组蛋白及其表观遗传信息）。
尽管基因重组可以在后代中表达多种性状，但Y染色体的大部分线性传播（n代单传）并不一定是一件坏事。实际上，这种特征使科学家能够了解男性血统的历史。
使用Y染色体来认祖归宗由于大多数Y染色体是不经重组传递的，因此该染色体上的DNA提供了男性父系祖先系的遗传史。[相对地，线粒体（细胞中产生能量的细胞器）中的DNA被用于母系的遗传研究，因为线粒体具有不同于核DNA的自身DNA，而我们仅从母亲那里继承线粒体DNA。实际上最近的研究发现父亲精子中的线粒体DNA也可能遗传给子女，这有可能会扰乱母系线粒体DNA的世系研究。]这里只讲父系，就不展开线粒体DNA了。
例如，2003年的一项研究对蒙古人的遗传世系进行了研究，蒙古人的领土曾经跨越人类历史上拥有最大连续领土的帝国。研究人员研究了整个亚洲范围内超过2100名男性的Y染色体，发现一项特征标记出现在从太平洋边缘到里海的大约8％的男性当中，约占全世界男性总数的0.5％，通过分析发现此Y染色体上的这一特征起源于约1000年前的蒙古。
研究人员得出结论，该Y染色体遗传特征的广泛传播不是偶然发生的，而可能是蒙古帝国首领成吉思汗的男性后代在如此广泛的地域上强势传播的结果。
虽然无法直接测试成吉思汗的Y染色体，但研究人员测试了巴基斯坦哈扎拉人的Y染色体，其族谱表明它们是成吉思汗的直接父系后代。该研究得出的结论是，根据代表各地区的2100多名男性样本推算，那么将有大约1600万具有Y染色体特征的男性可能都是成吉思汗的后代。
上图：欧亚大陆成吉思汗Y染色体携带者分布情况。内蒙古的蒙古族和汉族人以及巴基斯坦的哈扎拉人具有最多的携带者。圆圈越大则采样样本数越多（结果越可信），墨绿色的扇形是样本中阳性比例。
其他研究也发现了起源于中国和爱尔兰的其他非常成功的男性血统。尽管并非每个父亲在基因上都能如此繁荣，但使这些研究成为可能的是Y染色体上的那段微小的DNA序列。
如此微小的片段，就像是一块传家宝，从父到子几乎没有变化。这意味着某些特征确实仅通过Y染色体在父子之间传递。估计父权主义这时要热血沸腾了——请打住。实际情况并不像听起来那样意义重大，因为Y染色体只包含了很少量的DNA和有效基因，父亲唯一能通过Y染色体传递给儿子的特征只是那些将胚胎变成男性的特征，以及使男人一旦进入青春期就能够繁殖的特征，而不涉及任何其它特征，诸如身材、外貌、性格等等。所以那些被称为“成吉思汗”后代的男人们未必就长得像或者性格有半点像成吉思汗（之前看到过一个英国人也被检测出来说是成吉思汗的后代，而且据说欧洲还有十来万人都是如此）。
上图：Y染色体上仅有不到30个基因。因此父亲的传家宝并不是那么丰厚，就是留了一个男人的标签给你而已。呵呵~~
请注意，之前提到了Y染色体从父亲到儿子的传递几乎没有变化，但实际上它在代际相传时也会有所改变，甚至在此过程中也吸收了母系一方的一些基因，只是它不像我们大多数其他常染色体那样改变那么多。
Y染色体可以与X染色体以及自身发生重组
要了解DNA交换如何作用于X和Y染色体，我们需要追溯到大约3亿年前（三叠纪开始时，原始哺乳动物刚刚进化出来）。那时我们的祖先都有两个X染色体，没有Y染色体。
在某个时候，一对染色体中发生了DNA突变，产生了SRY基因，这就是使胚胎发育为雄性的基因。发生这种情况后不久，X和Y染色体就停止了重组，从而防止新生的SRY基因被“修复”。
随着时间的流逝，Y染色体失去了许多基因，并缩小为我们今天所了解的那个迷你染色体。发生这种情况的部分原因是，大多数Y染色体上的遗传物质无需进行重组。
上图：Y染色体是怎么通过缩短进化出来的？越来越短，直至消失？
最早两条染色体一样长，没有XY之分；
其中一条发生突变，产生了SRY基因；
随着时间推移，其他与性别相关的基因（蓝色）聚集到SRY基因周围（根本就是由于单传的原因，跟男性繁殖优势相关的基因就保留下来了，在X染色体上存在因而无关紧要的其他基因就飘走了）；
到今天，XY染色体就只有很少的部分能对得上。
Y染色体上只有大约5％的序列能够与X很好地匹配，并且可以发生重组（也就是说相互交换混合）。但是Y染色体上剩下的95％的序列需要能够找到重组的“对头”，否则它可能会完全消失！（就像已经失去Y染色体的南高加索鼹形田鼠一样）。
幸运的是，我们的Y找到了一个可以重组的伙伴——自己！
Y染色体内部保有其最重要基因的第二副本。这些副本以镜像或回文的形式存在，它们从前或从后读取都是一样的（例如，“ABCCBA”）。而Y染色体可以在自己内部的这些基因之间交换DNA片段。此第二副本很有用，因为它意味着Y染色体可以与其自身进行重组，以修复可能的错误并生成唯一的新的Y染色体以遗传给后代。因此，男性传递给儿子的可能是相似但不完全相同的Y染色体。
但是，这些并不是Y染色体发生的唯一变化。由于Y染色体的重组的效果比不上“正常”的重组，Y染色体就产生了容易吸收额外DNA突变的倾向，并将这些突变传递给子孙。
Y染色体吸收了世代之间的额外变化当DNA复制并分裂成新细胞时，复制机制有时会出错。但幸好我们的细胞具有出色的修复机制，可以捕捉其中的大多数的复制错误，并且几乎所有错误都可以通过重组来解决。
但是Y染色体因为没有正常的重组伙伴而不同，Y染色体的复制错误无法通过重组形式解决。这意味着儿子的Y染色体很容易与父亲的Y染色体产生一些差异，也意味着，父亲的Y染色体新产生的一些差异可以n代单传给男性后代。
如此就可以根据不同地域人群所拥有的突变来了解人类迁徙的历史（因为外迁者会带着原住民的Y染色体独特的突变标记），画出人类迁徙路线图。
上图：世界主要Y染色体DNA单倍群类型迁徙路线图。
总结Y染色体确实是祖祖辈辈的父系遗传下来的，可以用作家族谱系分析，这在如今这个商业基因测序如此发达的时代很方便就可以检测和了解自己的祖源。读者可以到网上搜一下基因检测，一般几百块钱就可以做几十万点位的检测，祖源信息是最标准的报告内容。
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